Contrôle transcriptomique et épigénétique de la plasticité phénotypique chez des saumons transgéniques

Ce projet vise à évaluer les variations épigénétiques (niveaux de méthylation) impliquées dans les réponses d'acclimatation des individus sauvages ou transgéniques de saumons coho (O. kisutch) en conditions de bassins ou de rivières naturelles simulées.

Date (Creation): 2017-09-01

Identifier: FR-330-715-368-00032-IFR_BIOINFO_WGBS_GXE_COHO_SALMON

Credit: Université McGill

Point of contact

IFREMER - Le Luyer Jeremy

GEMET - INSPIRE themes, version 1.0

Habitats et biotopes

Thèmes Sextant

/Milieu biologique/Bio-Informatique

ODATIS aggregation parameters and Essential Variable names

Bioinformatique

Use limitation: Accès restreint

Access constraints: Restricted

Use constraints: Restricted

Metadata language: Français

Character set: UTF8

Topic category

Environment

Reference system identifier: EPSG / WGS 84 (EPSG:4326) / 8.6

Distribution format

OnLine resource: /home/ref-bioinfo/ifremer/rmpf/wgbs_coho ( NETWORK:LINK )

Hierarchy level: Dataset

Statement: Des individus sauvages ou transgéniques (insertion gène de l’homone de croissance) ont été placés en jardin commun (environnement naturel recréé ou bassin d’aquaculture). Pour chacune des conditions des échantillons de foie ont été prélevés pour l’analyse du transcriptome (RNAseq) et des niveaux de methylation (whole genome bisulfite sequencing). L’objectif de cette étude vise à déchiffrer les mécanismes moléculaires de la plasticité phénotypique (genotype x environnement) associés aux patrons de croissance des juvéniles de saumon Coho.