Etablir une distribution spatiale des espèces de diatomées benthiques dans le Bassin d'Arcachon. Identifier les facteurs responsables de cette distribution (Salinité, température, stock en nutriments, texture du sédiment, courants) Utiliser le suivi saisonnier pour tirer des informations à long terme sur l'évolution des facteurs environnementaux naturels et anthropiques.

État initial (2001) et études d’impact (2003 à 2009) des peuplements benthiques et de la granulométrie dans le cadre de travaux de dragage et d’engraissement des plages du Pyla.

Dans le cadre d'un projet régional (2008-2009) une approche multi résidus (polluants organiques, inorganiques et organométalliques) a été entreprise. Celle-ci vise à définir l'état actuel de la contamination du Bassin d'Arcachon, par une caractérisation des apports anthropiques, une meilleure compréhension de la dynamique des contaminants dans le Bassin et une analyse de l'impact vis a vis des organismes et notamment de l'huître.

Comme tous les milieux côtiers soumis à des pressions anthropiques, le Bassin d'Arcachon subit des contaminations liées aux activités qui s'exercent dans la Baie ou sur son bassin versant. Les activités urbaines, agricoles, industrielles, domestiques et touristiques engendrent des apports de contaminants chimiques multiples et variés qui ont des conséquences sur l’environnement marin et sur l’homme. En particulier, les polluants métalliques peuvent se retrouver dans les eaux et les sédiments du Bassin d’Arcachon, impactant potentiellement les organismes aquatiques qui s’y trouvent. Les bivalves filtreurs notamment présentent de fortes capacités de bioaccumulation des éléments traces métalliques à l’origine de leur utilisation dans les réseaux de biosurveillance (Réseau National d’Observation, RNO). Cependant, très peu d’études jusqu’à présent se sont réellement intéressées à l’état de contamination des bivalves filtreurs dans le Bassin d’Arcachon, hormis les analyses réalisées sur les huîtres sauvages par le RNO. Concernant les bivalves fouisseurs, encore moins de données sont disponibles dans la littérature concernant le Bassin d’Arcachon. Pourtant, la coque, par son mode de vie enfoui dans les sédiments et en tant qu’organisme filtreur peut représenter une espèce particulièrement sensible à la présence de contaminants métalliques

Suivi de la mégafaune des herbiers à grande zostère (Zostera marina).

Variations saisonnières de la diversité taxonomique, de l’abondance et de la biomasse du macrozoobenthos sur 4 stations échantillonnées en 1993-1994.

Base de données sur la macrofaune benthique invertébrée d'une station échantillonnée dans le Bassin d'Arcachon depuis le 11 décembre 2006.

Il s'agit d'enregistrements de profil de courant, marée et vagues effectués dans la passe Sud au moyen d'un profileur ADCP RDI.

Les eaux qui circulent à marée basse dans les esteys déconnectés des rivières sont alimentées par les eaux interstitielles des sédiments. De ce fait, ces eaux sont chargées en composés réduits issus du recyclage de la matière organique. Ce "pompage tidal" transfère vers la colonne d'eau du Bassin d'Arcachon autant de sels nutritifs que la Leyre.

Il s'agit d'un suivi des évènements d'érosion/dépôt d'un estran colonisé par un herbier de Zostera noltii. Les altimètres ALTUS mesurent en continu la hauteur du sédiment, les vagues et la marée.